​De PCR wordt zeer uitgebreid toegepast in het kader van onderzoek, maar ook steeds meer in de routinediagnostiek. Belemmerend voor de invoering in de routinediagnostiek is met name de contaminatiegevoeligheid: doordat het te onderzoeken DNA miljoenen tot miljarden malen wordt vermenigvuldigd, leidt een geringe contaminatie van het te onderzoeken materiaal al gauw tot een fout-positieve uitslag. Daarom moet er in aparte ruimten worden gewerkt tijdens de verschillende fasen van de diagnostiek. Daarnaast is er aparte apparatuur nodig en zijn voldoende deskundigheid en ervaring van de uitvoerende analist vereist.

Naast de detectie van micro-organismen en het aantonen van erfelijke ziekten wordt de PCR ook veel gebruikt voor onderzoek op archeologische monsters. Doordat DNA zeer stabiel is, is het mogelijk de PCR uit te voeren op DNA van miljoenen jaren oud.

Terug naar moleculaire biologie